明朝自公元1368年由朱元璋建立，到公元1644年崇祯帝自缢于景山，历经276年，前后共有16位皇帝，奇怪的是明朝既然有16位皇帝但是在北京的明十三陵中只有13位皇帝的陵墓。
其实这也不足为奇，翻开有关明朝的历史我们会发现，开国皇帝朱元璋在建立明朝时，起初选定的都城是南京，朱元璋死后葬在南京的钟山之阳，史称“明孝陵”。
明朝的第二代皇帝建文帝朱允炆，在其叔父朱棣发动“靖难之变”后逃离了南京，最后不知下落，所以他的陵墓更是无从查起。后来有关历史学家分析，他可能是逃到了今天的云贵一带，也有可能是死于那场战乱之中，但终究也没有一个准确的结论，至今仍是明朝历史上的一大悬案。
明朝的第七位皇帝朱祁钰，是因为明英宗朱祁镇在“土木堡事变”中被瓦刺所俘虏后，在大臣和太后的旨意下才登基称帝的。后来英宗被放了回来，在英宗心腹的策划之下，发动了“夺门之变”，又将皇位夺了回来，而代宗朱祁钰被处死。朱祁钰死后英宗不承认他是明朝的皇帝，所以以藩王的身份将其葬在了北京西郊玉泉山北麓的金山口。
就这样，明朝虽然有16位皇帝，其中开国皇帝朱元璋的陵墓在南京，建文帝朱炆下落不明，代宗朱祁钰葬于金山口，所以北京的明十三陵中就只有13座陵墓了。
